Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms