Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nhlrc2Q8BZW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms