Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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