Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp38Q8BW70 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp38Q8BW70 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp38Q8BW70 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp38Q8BW70 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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