Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms