Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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