Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy1Q8BIJ7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms