Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd3Q8BHD4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms