Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms