Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Npm2Q80W85 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Npm2Q80W85 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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Npm2Q80W85 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npm2Q80W85 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms