Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcsk9Q80W65 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms