Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms