Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms