Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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