Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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