Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trappc6aQ78XR0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6aQ78XR0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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