Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms