Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Senp6Q6P7W0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp6Q6P7W0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms