Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NesQ6P5H2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NesQ6P5H2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms