Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac10Q6P3E7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms