Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms