Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm4Q6IRU2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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