Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg9bQ6EBV9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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