Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd6Q69ZL1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms