Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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