Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna3Q65CL1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms