Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2bQ64511 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms