Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2e1Q64104 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms