Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc18Q640L5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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