Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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