Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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