Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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