Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms