Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mkrn3Q60764 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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