Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Epha1Q60750 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms