Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms