Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb6Q60692 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms