Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms