Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms