Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TefmQ5SSK3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms