Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms