Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms