Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf3Q5HZG4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms