Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms