Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spsb3Q571F5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms