Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm10488Q4KL05 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms