Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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