Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Snx25Q3ZT31 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms