Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms