Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms